厄特加尔城一役后,与莱纳·布朗变身的铠之巨人战斗,即将胜利之时被贝特霍尔德·胡佛变身的超大型巨人砸中而昏厥,与尤弥尔一起被两人带走。尤弥尔在莱纳的鼓动下,加入了回乡三人组的行列,并且带走了赫里斯塔·兰斯。后被随后赶来的调查兵团从莱纳手中救下,但与三笠同时陷入危机。
因汉尼斯被当年吃掉妈妈的那个巨人吃掉,艾伦几近精神崩溃陷入绝望,同样求生无望的三笠对艾伦凄美告白,感谢艾伦为其所做的一切,并露出幸福的笑容,深受感动的艾伦回忆起妈妈的话,重新振作决意保护三笠,并立下红巾之约。最终艾伦为保护三笠而爆发出强大的意志力,接着,他获得“坐标”之力(疑似能用意念控制其他无垢巨人的能力)。
受到支配的无垢巨人们对曾吃掉其母亲的巨人群起而攻将其啃蚀殆尽。之后因为对铠之巨人表露敌意,而使大批无垢巨人转而攻击铠之巨人与超大型巨人,在摆脱了巨人们的纠缠之后,艾伦背起受伤的三笠与调查团同伴们一起逃离险地。实际上,艾伦之所以能够发动“坐标”之力,是因为他是始祖巨人的宿主,而吃掉艾伦母亲和汉尼斯的巨人戴娜·弗里茨拥有弗里茨王室血统。当非王室血统的始祖巨人宿主和拥有王室血统的巨人接触时,便会发动“坐标”之力。
艾伦与幸存的调查兵团同伴们一起撤回罗塞之墙,原本出动救援艾伦的联军(调查团主力与宪兵团主力)人数有一百人左右,撤回墙壁时有六成士兵阵亡,艾伦深感内疚。让·基尔希斯坦在艾伦迷茫时用“艾伦式说教”帮助艾伦重新确立目标:用自己“坐标”的能力驱使巨人堵上玛利亚之墙以及手刃莱纳等人。一周之后,伤愈的利威尔在听完韩吉·佐耶与康尼·斯普林格关于巨人的情报后,与正在养伤的艾尔文·史密斯商议确定组建新利威尔班。艾伦与三笠、阿明等训练兵团104期出身的同伴们一起加入了新利威尔班。
对战莱纳第一次帕拉迪岛内乱艾伦和调查兵团暂时藏身在山中的木屋里,在韩吉和利威尔的安排下进行探究巨人化特质的研究和实验。掌握了有关艾伦巨人化次数极限,变身后知能程度等等情报,同时失望地得知艾伦尚且对如何硬质化毫无头绪,使得阿尔敏设想的“利用硬质化的残留巨人之躯封堵城门”的计划无法实施。另一边,同期生的克丽丝塔·连兹向众人坦白了身份:原来她真名为希斯特莉亚·雷伊斯,是伪装成普通贵族的墙内真实王族——雷伊斯家的私生女。
此时韩吉和利维接到身处中央的埃尔文通报,中央有人要强取艾伦和希斯特莉亚。纵然韩吉等人想尽办法掩护,艾,希二人还是落入了中央宪兵之手。在雷伊斯家庄园的秘密地下洞窟中,艾伦被锁链绑在高台上,而希斯特莉亚则和生父罗德·雷伊斯重逢。通过和雷伊斯父女的身体接触,艾伦体内潜藏的部分记忆被唤醒:原来艾伦的父亲格里沙是巨人之力的持有者。在玛利亚之墙陷落的当晚,格里沙来到雷伊斯家的地窖,将罗德的长女弗丽达·雷伊斯变身的巨人打败并吞食了本体,由此夺得了雷伊斯家传的,能支配一切巨人的“始祖巨人”之力,并将罗德的在场的其他孩子也全部杀死。