庙宇高三层，整栋通高和第一层面阔均约十米左右，越上层面积越递减。
内墙与天花板纹饰及三尊主要供像的腰布彩绘具有极高的艺术成就。
大殿入口是一个木质门廊，历经千年，不倒不朽。
木质门廊的柱头形制，来自古代希腊石雕门柱，但有所简化，已经演变成经典的藏式建筑木柱。
木质横梁间有三个三角形框，每个里面都有一尊健陀罗风格的佛像。
大殿一层，入口处绘有壁画。
左下侧胁侍头戴骷髅冠，左手奉嘎巴拉碗，右手持剑。
右下侧胁侍身披孔雀羽斗篷，右手持金刚杵，左手奉嘎巴拉碗。
该殿第一层西壁、东壁和北壁各开一大型佛龛，分别供奉观音、文殊及弥勒菩萨立像。
根据弥勒菩萨足侧的题记，此三尊依次代表密教要义之身、语、意三业。
周围墙壁上密布着精美的图案，包括佛像、曼荼罗、人物、动物、花卉等等。
观音和文殊皆高四米左右，弥勒高有五米，头部和龛顶延伸至第二层。
三尊像均为四臂，各结印相，戴高耸宝冠，身饰璎珞，下身彩绘腰布，各以其特定主题描绘种种图景，构图精丽细致，极具特色。
观音菩萨腰布上分布佛教寺院，印度禅殿，宫殿民房等世间建筑，共十四座，并有佛、菩萨、神祗像及社会各阶层人物跃然其间，似代表观音慈悲救度迷悟众生。
弥勒菩萨腰布密布排列规整的圆轮，内六十余幅佛传图，内容偏重佛陀成道前之事迹。
另有，其为菩萨时住于兜率天的景象。
从弥勒为未来佛和彩图题材推测，这些图像应为表现弥勒当来下生，一如释迦牟尼佛般成道度众。
文殊菩萨腰布主要描八十六尊大成就者像，代表菩萨之大智慧。
构图以无数七彩小方格，对角排列，划分出八十五个区块，内绘或单独或有伴之大成就者。
另于文殊股间下绘制有一身形较大的坐像，当为那洛巴尊者。
诸像身形，姿态迥然不同。
东西北三壁龛外两侧壁和南壁绘制佛、菩萨像，总计能计逾三千尊。
包括西壁八百一十四尊阿弥陀佛坐像，东壁七百二十八尊文殊菩萨坐像，北壁七百一十二尊阿閦佛坐像及南壁一千零六十三尊阿閦佛坐像，俨然为壮丽的千佛化境。