扎什伦布寺的殿堂建筑在突出宗教与民族特色的同时，更凸显文化底蕴。
在扎什伦布寺中，大经堂是与寺庙共生的最早建筑之一，是整个寺院僧人打坐诵经的主要场所。
整个大殿面积达到600多平方米，大经堂内壁四周，在墙壁上密密麻麻地掏凿出上千壁龛，内部供奉如来佛祖，天王罗汉、各种飞天神女、菩萨造像。
整座大殿内部矗立着48根红木圆柱，托举着巨大的房梁，房梁上垂挂着道道经幡，在室内随着窗外吹进的凉风徐徐飘动。
大殿正中供奉着班禅在此讲经解惑时的宝座，数百年间一直在此停留。
在大经堂左侧，有一大佛堂。
走进殿中，一尊11米高的弥勒佛像坐卧其中，成为大佛殿最醒目的室内陈设。
在大佛殿右侧供奉着两米多高铜制白度母佛像。
大佛堂内部地面以雪山特有的片岩铺就。
大经堂与大佛殿屋顶以传统藏式宫殿形式设计，从中掺杂了中原宫殿飞檐斗拱特征，屋顶瓦片以闪亮的金黄色鎏金覆盖。
在扎什伦布寺内有一座专门供奉清朝皇帝赏赐物品的殿堂，甲纳拉康佛堂，其译注为汉佛堂。
整座大殿内陈设考究，内部珍藏着历代皇帝向班禅赠送的各种佛教器物，经书手谕，册封官印和珠宝玉器。
与汉佛堂紧紧相连的是一座规模较小的偏殿，明清时期朝廷对班禅进行册封时，朝廷使臣与班禅进行秘密会晤就在此殿中进行。
殿中现保存许多皇帝手谕和大幅画像。
在正面墙上，悬挂着乾隆身穿袈裟，收转法轮的画像，下面是皇帝册封时供奉的牌位。
强巴佛殿，是扎什伦布寺里比较宏大的殿宇建筑，因殿内有一尊高近30米的强巴大铜佛而着称。
强巴佛殿上下分为莲花殿、胸部殿、面部殿和冠部殿五层，从大殿攀登到顶层，共有木梯105阶。
整个建筑墙体以条石垒砌而成，条石之间搭配协调缝隙紧密，底部面积862米，随着层数而逐渐收拢。
底下两层楼面内有回廊环绕，每层的四角各铸有铜狮一尊，整体硕大，威武雄壮有力。
强巴佛自底层起，直至五层，面南背北，以端庄姿态俯视整个殿宇，其高26.2米，肩宽11.5米，耳长2.2米，仅眉宇间镶饰的大小钻石就有32颗，珍珠、琥珀、珊瑚、松耳石有1400多颗。
整体结构和谐自然，造型优美生动，是巨型雕塑中难得的精品。