在这种政治体制下，天皇可以通过在各个国务机关进行调节的方法来使自己的意志得以贯彻，而明治宪法第三条又规定了一条条款是天皇神圣不可侵，这样就给皇权披上了一层无法穿透的外衣。天皇的意志在各国务机关的辅佐下实施的同时，天皇本人获得了政治上的免责。
明治初年，政府中各蕃阀势力根深蒂固，同时各地的武装叛乱和自由民权运动也层出不穷，也就是在这一时期，各利益集团在长期政权独立的过程中达成了妥协。
为了避免某一集团获得超出其他人的权利，坐上大位，天皇被奉为了最高的权力机关，掌管了帝国的一切权力。但是明治天皇本人的权威来自于维新众臣的势力，他不可能突破这些萨长重臣的势力来树立自己的独立权威。
但好在明治天皇本人思想相当西化，对于君主立宪制接受程度较高，主动干预国政的情况少之甚少，因此在明治时期，通过维新功臣的个人能力和天皇的绝对权威，日本形成了一套行之有效的政策实施体制。
明治天皇去世后，皇太子嘉仁继位，是为大正天皇。嘉仁是明治天皇第三子，也是唯一活到成年的皇子。
不过这位唯一活下来的大正天皇也是命运多舛，打小就患有脑膜炎和百日咳，13岁又得了伤寒，16岁又患上结膜性肋膜炎和肺炎，几乎属于是纳垢的人间实验体。
由于自幼身体不好，在认知和行动上存在障碍，学业也受到了很大影响，故而天皇在政治上的影响力减弱。
在这一时期，维新功臣们开始逐步退出历史舞台，政党政治开始崛起，元老们相继去世。
从1901年开始，日本进入了桂太郎和西园寺公望轮流执政的情景，分别经过了三次桂内阁和两次西园寺内阁。
后来当第三次桂内阁因为第一次护宪运动下台之后，西园寺公望拒绝出任，转而推了山本权兵卫，自己则坐镇幕后，用元老的身份向天皇辅佐国政。
山本内阁迅速完蛋之后，山县有朋，松方正义，大山岩几位元老在当时的小辈政治家中进行选择。
山县有朋自己拒绝出任，德川家达拜辞大命，清浦奎吉没有得到海军的支持，无法找到海相，西园寺公望也选择了退休。最终只能由大隈重信出任内阁首相。