晋王李存勖灭亡后梁，建立后唐。高季昌得知后，为避李存勖祖父李国昌之讳，将名字由“季昌”改为“季兴”，并在司空薰等人的劝说下，打算入朝朝觐。梁震劝道：“大王不可入朝，梁朝与唐朝有二十年的世仇，大王是梁朝旧臣，手握强兵，占据重镇，如果亲自入朝，恐怕有去无回。”高季兴不听，亲自前往洛阳朝见。
高季兴入朝后，被任命为中书令，唐庄宗果然有意扣留高季兴，郭崇韬进谏道：“陛下得到天下，各地诸侯都只是派人进贡，只有高季兴亲自前来，您应该褒赏他以为表率。若是把他扣留，怎么能使天下诸侯归心呢？”唐庄宗命高季兴回江陵，高季兴急忙离去。高季兴走后，唐庄宗又后悔了，密命襄州节度使刘训在中途将其截留，唐庄宗的密诏到达襄州时，高季兴早已连夜离开。到襄州，酒喝到酣畅时，对孔勍说：“这一趟有二错：我去朝拜是一错，他们放回我是二错。”
高季兴返回江陵后，握着梁震的手道：“没听您的话，差点不能回来。”众人问朝中的形势，高季兴道：“新皇帝刚刚得到河南，便举掌对功臣道：‘我在手指头上夺得天下。’灭亡梁朝岂是他一个人的功劳？皇帝如此骄傲，功臣无不寒心。而且荒于酒色，当不了多久了。我没什么可担心的了。”因此，高季兴在江陵修缮城池，储备粮食，招纳梁朝散兵，以备将来，兼任尚书令，进封南平王。
唐庄宗命魏王李继岌与郭崇韬率兵伐蜀，高季兴请求率荆南兵马取夔州、忠州和万州、归州、峡州等地，被任命为东南面行营都招讨使，但高季兴并未出兵。李继岌灭蜀后，命人押送财物乘船顺江而下，准备运往洛阳。兴教门之变，唐庄宗被杀，高季兴得知，便杀死使者，将货物截留。
唐明宗即位后，高季兴索要夔州、峡州为属郡，朝廷同意了他的请求，但仍要委派刺史。高季兴又表示已派子弟前去，要求朝廷不要委派刺史，唐明宗大怒，削除高季兴官爵。唐明宗任命襄州刘训为招讨使，讨伐高季兴。不久，别将西方邺攻取夔州、忠州、万州，高季兴以荆州、归州、峡州三州之地向南吴称臣，被册封为秦王。
高季兴因脚气病病故，终年七十一岁，长子高从诲继位后，上表向后唐请罪，后唐任命高从诲为荆南节度使，并追封高季兴为楚王，赐谥号武信。