正当他们准备返回汇报时，通讯频道被一股强大力量入侵，屏幕上浮现出一张扭曲狰狞的面孔，正是邪恶文明的首领“混沌主宰”。他发出狂笑：“联盟，你们的末日到了！今日这片苍穹就是你们的葬身之地！”说罢，切断通讯，紧接着，一群由暗能量凝聚而成的诡异战机从“暗影苍穹”中蜂拥而出，向侦察队发起攻击。
林宇博士立刻指挥飞船还击，船上的能量炮虽然威力不俗，但面对数量众多、机动性极强的敌机，渐渐陷入劣势。关键时刻，艾丽得知侦察队遇袭，果断派出一支救援小分队，搭乘特制高速穿梭机赶来支援。他们携带的新型干扰弹，能短暂瘫痪敌机的暗能量驱动系统。救援人员凭借精湛技艺，在空中划出一道道惊险弧线，投放干扰弹，为侦察队创造反击机会。
在激烈交火中，一架敌机突破防线，直扑林宇博士的飞船。驾驶员小陈毫不犹豫，驾驶飞船侧身硬撞，以牺牲自己为代价，保护了关键数据与队友安全。林宇博士等人强忍悲痛，利用敌机阵脚大乱之机，成功突围，带着珍贵资料返回联盟。
与此同时，联盟主力舰队与“暗影苍穹”前沿的黑暗力量正面交锋。杰克船长一声令下，战舰齐射，能量光束如璀璨流星，冲向敌阵。但黑暗力量借助扭曲时空，轻易化解攻击，还不时发起突袭。一艘战舰护盾被击破，船身燃起大火，舰长仍坚守岗位，组织船员抢修，高呼：“为了联盟，绝不后退！”
艾丽见状，迅速协调联合救援网络，从临近星系调配来一批强力护盾发生器，紧急输送至受损战舰，助其稳住防线。同时，她带领地面部队，在星球表面构建防御工事，准备应对可能的登陆袭击。