踏入山谷，一股腐臭的气息扑面而来。在山谷深处，他们发现了一艘坠毁的巨型战舰残骸，其金属外壳被腐蚀得千疮百孔，周围散落着一些不明生物的肢体碎片，散发着诡异的微光。玲操控机甲上前扫描，数据显示这些碎片的细胞结构前所未见，似乎处于一种不断变异的状态。
正当众人收集样本时，阴影中传来一阵低沉的咆哮。紧接着，一群形似蝙蝠却体型巨大的生物呼啸而出，它们周身环绕着黑色雾气，牙齿和爪子闪烁着寒光，朝着众人俯冲而来。凯反应迅速，双手舞动，水箭如暴雨般射向敌群，然而这些生物只是略微受阻，便继续扑来。托姆大喝一声，等离子束在手中汇聚，向着空中扫去，一时间，火光与黑影交织。
战斗中，艾娃发现这些生物似乎受某种核心力量驱使，她向泽尔喊道：“用你的灵觉找找它们的控制中枢！”泽尔强忍着精神冲击，集中精力搜索，片刻后，指向山谷一侧的山洞：“在那里！”玲和凯对视一眼，并肩向着山洞冲去，身后是队友们火力掩护。
山洞内阴暗潮湿，弥漫着刺鼻气味。在洞底，他们发现了一颗巨大的黑色水晶，水晶中涌动着暗影能量，那些生物正是从水晶中源源不断地诞生。凯试图用水系异能包裹水晶，阻断能量传输，却发现异能被迅速吞噬。玲见状，操控机甲手臂变形，伸出能量吸收装置，试图反向吸取水晶能量，然而水晶突然释放出强大的脉冲，将机甲震飞。
此时，洞外的队友们渐渐不支，黑色生物越来越多。洛恩大喊：“必须毁掉水晶！”凯急中生智，想起之前在堡垒的经历，对玲说：“我们结合异能和机甲能量，试试共振攻击！”玲点头，二人全力施为，凯输出水流包裹水晶，玲操控机甲释放能量波，逐渐，水晶开始颤抖。泽尔和艾娃也赶来支援，泽尔以灵觉稳定共振频率，艾娃借助周围植物力量，为大家输送能量。
在众人齐心协力下，黑色水晶轰然炸裂，那些暗影生物瞬间消散。但危机并未解除，透过山洞顶部的裂缝，他们看到天空中一道巨大的异次元裂缝正在缓缓撕开，熟悉的黑暗气息扑面而来。
洛恩意识到，这是一场早有预谋的入侵，远比想象中更严重。他立刻通过通讯器向联邦议会汇报，同时组织学员们撤退，准备迎接即将到来的更大风暴。回到飞船后，众人望着那不断扩张的异次元裂缝，眼神中没有恐惧，只有坚定。他们知道，守护宇宙的征程，才刚刚开始，而接下来的战斗，将决定无数生命的存亡……