然而，他们的行动很快就引起了那些权贵势力的警惕。以权臣王敦为首的一伙人，视刘辨和谢安等人为眼中钉肉中刺，开始暗中设计陷害他们。
一日，朝堂之上，王敦突然上奏，弹劾刘辨在地方上结党营私，意图拥兵自重，其言辞凿凿，还拿出了一些伪造的证据。皇帝听闻后，龙颜大怒，当即下令将刘辨打入大牢，等候审讯。
刘辨被押入大牢后，遭受了各种威逼利诱，那些人妄图让他承认莫须有的罪名，从而扳倒他身后的一干人等。可刘辨宁死不屈，他义正言辞地反驳那些诬陷之词，向前来审讯的官员讲述自己所做的一切皆是为了百姓、为了国家的安定统一。
与此同时，谢安在外四处奔走，联络朝中的正义之士，试图为刘辨洗清冤屈。他们收集证据，证明王敦所拿出的证据皆是伪造，又向皇帝上书，力陈刘辨的忠心与功绩。
在这一番艰难的较量中，整个建康城都被搅得风云变色。百姓们听闻刘辨的遭遇，纷纷自发地聚集在宫门外，为他请愿，请求皇帝明察秋毫，还刘辨一个公道。那场面，人山人海，呼声震天，让皇帝也不得不重新审视此事。
最终，经过多日的查证与辩论，皇帝看清了真相，下令释放刘辨，并严惩了王敦等伪造证据、诬陷忠良的人。刘辨走出大牢的那一刻，阳光洒在他身上，他看着前来迎接他的谢安以及那些支持他的人们，心中满是感动与欣慰。
经此一役，刘辨在建康城的声望更高了，越来越多的人开始认可他、支持他。而刘辨也没有因此而骄傲自满，他深知，这只是万里长征的第一步，要想真正改变晋朝的命运，还有无数的艰难险阻在等着他。
在之后的日子里，刘辨与谢安等人更加紧密地合作，他们向皇帝进献了一系列关于加强中央集权、安抚流民、发展经济以及抵御北方少数民族侵扰的策略。皇帝经过深思熟虑，采纳了其中部分建议，并委派刘辨等人负责实施一些具体的事务。