回到联盟后，林羽并未放松下来。他深知，虽然一次次化解危机，但保不准什么时候又会冒出新的威胁。
一日，联盟探测到一个神秘信号源，位于一片死寂的星云之中。林羽率队前往探查。到达目的地后，发现一艘巨大无比的古代飞船残骸。船身上有着许多未曾见过的符号与阵法图纹。
当林羽等人登船后，触动了船上的机关。一群机械傀儡苏醒过来，个个身形矫健，攻防一体。林羽率先出手，运足内力轰向傀儡。其他队员也纷纷施展技能。战斗中，林羽意外发现这些傀儡的动力源是一种全新形式的能量石。
就在他们全力应对傀儡时，飞船深处传出低沉的笑声。一个身着古老服饰的神秘人缓缓走出，声称要借助众人开启飞船隐藏的终极兵器，统治宇宙。林羽目光坚毅，与队友默契配合。经过一场惊心动魄的大战，林羽找到神秘人的破绽，一举将其击败。随后，林羽命人带走能量石研究，以免再被恶用，接着便带着队伍返回联盟，继续坚守守护宇宙和平的使命。回到联盟后，关于那种新型能量石的研究取得了重大突破。林羽得知这种能量石不仅可以成为强大的能源，还能够提升武者的功力。然而，消息不知为何泄露出去，引来了各方势力的觊觎。
一些邪恶组织暗中勾结联盟中的叛徒，策划抢夺能量石。一天夜里，联盟基地遭到突袭。林羽带领队友仓促应战。面对数倍于己的敌人，林羽冷静指挥。他让一部分队友护送能量石转移至安全地点，自己则留下断后。
林羽施展出最强武技，一时间光芒万丈，震慑住不少敌人。但敌人太多，渐渐有些力不从心。就在关键时刻，前去护送能量石的队友及时赶回，带来了一批以能量石强化后的武器装备。众人如虎添翼，很快扭转战局，将来犯者全部击退。
经此一役，林羽意识到保护宇宙和平任重道远，必须更加小心谨慎对待每一个潜在危险，于是加紧训练联盟成员，随时准备迎接下一次挑战。几日后，林羽得到线报，一个名为暗影教的新兴邪教正在秘密收集制造能量石的材料，意图大量生产能量石打造无敌军团。林羽决定主动出击，率领精英小队悄悄潜入暗影教的据点。
进入据点后，他们发现这里布满各种诡异的机关陷阱。林羽利用高超的武艺和敏锐的感知，带领队员们小心翼翼地前行。终于，他们找到了正在举行仪式妄图合成能量石的教徒们。